五裂黄连在黄连之中是非常稀有的，也是我国的二级重点保护动物，其在医药之中也是有着很大的药用价值，整体经济价值是比较高的。由于长期过度采挖，野生居群已处于灭绝的边缘。国内其他种类的黄连属植物目前大部分种类也受到严重破坏，大多处于濒危状态。