学校建于1890年，是一所具有百年悠久历史的老校。学校拥有吴航校区（本部）与首占校区两个校区。吴航校区坐落于长乐城区和平街56号。校区面积102亩，建筑面积3.86万平方米；首占校区位于长乐区会堂南路99号，有初中和高一四个年段，前身是长乐第一中学一分校，成立于2014年7月，校园占地面积150亩，建筑面积8.5万平方米。