甘丹颇章是哲蚌寺的寝宫，是五世达赖喇嘛在拉萨的住所。在布达拉宫重建之前，五世达赖喇嘛在这里居住，并且在此期间被固始汗授予西藏政教大权。甘丹颇章也成为西藏政府的同义词，被称为“甘丹颇章政权”。这个政府的实际领导者是格鲁派摄政者索南群培。甘丹颇章是哲蚌寺第十任堪布于1530年兴建的，共有7层，主要包括前院、中院和后院。达赖喇嘛的生活主要在7楼，包括经堂、卧室、讲经堂和客厅等。