大明山于1958年建立为国有林场，1981年转型为自治区级水源林保护区，2002年经国务院批准升级为国家级自然保护区。管理机构更名为广西大明山国家级自然保护区管理局，2004年划归南宁市管理。2005年，南宁大明山风景区管委会成立，与大明山管理局实行一套人马，两块牌子的管理体制。